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1、制定检查计划。市财政局根据财政管理需要，制定年度财政检查计划，报市政府批准同意，或根据举报和日常财政管理过程中发现的问题，即时开展检查。
2、实施检查。
（1）组成检查组。检查组检查人员由具备条件的财政部门工作人员组成，不得少于２人，实行组长负责制。根据需要可以聘请专门机构或专门人员协助检查。
（2）发送检查通知到被查单位。
（3）调查取证。检查人员通过审查被查单位的有关会计凭证、会计账簿，查阅有关文件、资料，检查有关现金、实物、有价证券，向有关单位和个人进行调查等方式实施检查，并取得有关的证明材料，编制财政检查工作底稿，并由被查单位签字或盖章。
（4）征求意见。检查结束前，检查组就检查工作的基本情况、被查单位存在的问题等事项书面征求被查单位的意见。被查单位自收到书面征求意见函之日起5个工作日内，提出书面意见或说明；在规定期限内没有提出的，视为无异议。
（5）提交检查报告。调查取证结束后，检查组向派出的财政机关提交书面财政检查报告；
3、检查复核。
对检查组提交的财政检查报告及其他有关材料，由指定的内部职能机构或专门人员进行复核。如财政检查报告与复核意见存在重大分歧的，财政部门责成检查组进一步核实、补正有关情况或材料；必要时，另行派出检查组，重新实施检查。
4、处罚告知。
财政部门在作出行政处罚决定之前，应告知被查单位作出行政处罚的事实、理由及依据，被查单位或当事人有权进行陈述和申辩。
5、处理与处罚。
财政部门对财政检查报告和复核意见进行审定，根据情况作出处理或处罚决定，对不属于本部门职权范围的事项依法移送。
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